Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIA4P48058 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIA4P48058 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms