Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOXA7P31268 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms