Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHRNA5P30532 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHRNA5P30532 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms