Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TM4SF1P30408 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF1P30408 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms