Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PEX2P28328 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PEX2P28328 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms