Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ABCD3P28288 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms