Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PTPRDP23468 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PTPRDP23468 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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