Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRBP23467 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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PTPRBP23467 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PTPRBP23467 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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