Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTGS1P23219 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTGS1P23219 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms