Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM21P19474 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms