Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GP1BBP13224 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms