Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GLI4P10075 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GLI4P10075 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GLI4P10075 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GLI4P10075 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms