Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EGFRP00533 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EGFRP00533 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EGFRP00533 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGFRP00533 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGFRP00533 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGFRP00533 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EGFRP00533 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EGFRP00533 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGFRP00533 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGFRP00533 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EGFRP00533 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EGFRP00533 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EGFRP00533 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms