Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABARAPO95166 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms