Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ECM2O94769 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ECM2O94769 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ECM2O94769 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ECM2O94769 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ECM2O94769 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms