Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP3O75154 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP3O75154 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms