Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6DO43924 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6DO43924 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6DO43924 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6DO43924 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6DO43924 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6DO43924 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6DO43924 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6DO43924 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6DO43924 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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PDE6DO43924 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PDE6DO43924 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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