Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PHF1O43189 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PHF1O43189 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PHF1O43189 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms