Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VGFO15240 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VGFO15240 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VGFO15240 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VGFO15240 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VGFO15240 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VGFO15240 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
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