Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APAF1O14727 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
APAF1O14727 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
APAF1O14727 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APAF1O14727 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms