Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PTPRTO14522 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPRTO14522 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
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