Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
J3KR12 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
J3KR12 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
J3KR12 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
J3KR12 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms