Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP17L13C9JLJ4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms