Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALM3A6NDB9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PALM3A6NDB9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms