Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP17L4A6NCW7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP17L4A6NCW7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms