Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms