Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDHAC2Q9Y5I4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDHAC2Q9Y5I4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHAC2Q9Y5I4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms