Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms