Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNH4Q9UQ05 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms