Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TTF2Q9UNY4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms