Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DENND2AQ9ULE3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms