Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDV3Q9UKY7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms