Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MLH3Q9UHC1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MLH3Q9UHC1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms