Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
COPS7AQ9UBW8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
COPS7AQ9UBW8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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