Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ARHGEF12Q9NZN5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARHGEF12Q9NZN5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms