Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DNAJC28Q9NX36 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
DNAJC28Q9NX36 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms