Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FBXO28Q9NVF7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms