Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AKIP1Q9NQ31 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms