Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LIN28AQ9H9Z2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LIN28AQ9H9Z2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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