Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBPF3Q9H094 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms