Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MCOLN1Q9GZU1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms