Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLIRPQ9GZT3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms