Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
POLR1EQ9GZS1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
POLR1EQ9GZS1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms