Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SETD2Q9BYW2 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SETD2Q9BYW2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms