Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SHANK3Q9BYB0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SHANK3Q9BYB0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms