Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC4A5Q9BY07 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC4A5Q9BY07 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms