Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAGR1Q9BTK6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAGR1Q9BTK6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms