Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MESP1Q9BRJ9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms