Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPN18Q99952 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms