Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
POP1Q99575 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POP1Q99575 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POP1Q99575 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POP1Q99575 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
POP1Q99575 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
POP1Q99575 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POP1Q99575 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms